Chương trình Mục tiêu Quốc gia (CTMTQG) về Nước sạch  và VSMTNT được thiết lập nhằm thực hiện Chiến lược Quốc gia về Cấp nước và Vệ sinh nông thôn tới năm 2020. Hai giai đoạn của chương trình đã được triển khai. Giai đoạn 3 là phiên bản nâng cao của CTMTQG (CTMTQG3) được triển khai tại 8 tỉnh liền kề.

Nhằm đạt mục tiêu dần biến đổi CTMTQG thành một hệ thống hiệu quả và tập trung hơn để thực hiện các khoản đầu tư bền vững, Chính phủ thực hiện một chương trình Hỗ trợ kỹ thuật một phần nhằm cải thiện năng lực giám sát & đánh giá, đúc kết bài học kinh nghiệm trên toàn bộ (CTMTQG3) trên toàn quốc.